HRM技术服务之SNP检测
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插进,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,尽大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就是SNP。 SNP在人类基因组中数目较多,发生频率较高,因此被以为是继微卫星之后的新一代遗传学标记。
检测SNP的方法有很多种。本钱较低、通量较大的方法大都局限于已知、特定位点,如Taqman探针法。既要对已知位点分析又要查找未知位点,一般采用PCR+测序的方法,本钱高、操纵繁复较低。 作为新一代的遗传扫描工具,HRM技术是一种低本钱、高通量、快速,且不受位点局限的检测方法,是SNP筛查的最佳选择。
HRM检测SNP技术是依据在一定的温度范围内将PCR扩增的产物进行变性,期间实时检测体系内荧光信号。荧光值随着温度变化,可绘制溶解曲线。每一段DNA都有其独特的序列,因而也就有了独特的熔解曲线外形,如同DNA指纹图谱一样,具有很高的特异性、稳定性和重复性。根据曲线正确区分野生型纯合子、杂合子和突变性纯合子(下图)。
HRM技术特别适用于样本量多、检测位点较少的SNP、突变或甲基化分析,是不同于基因芯片检测方法(检测位点多,样本少)的高通量方法。同时,也是基因芯片筛选后的多个基因在更多标本中验证的最佳方法。
实验仪器
Eppendorf自动加样工作站及Roche480II荧光定量PCR仪
服务周期
根据样品量等情况而有所不同
服务提供
样本、相关材料
实验结果
详细实验报告一份,含所需试剂耗材、仪器设备及操作过程等;